MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum YAU B9601-Y2

Total Repeats: 78337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017061	AT	3	6	419	424	50 %	50 %	0 %	0 %	384263632
2	NC_017061	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263632
3	NC_017061	CTGG	2	8	567	574	0 %	25 %	50 %	25 %	384263632
4	NC_017061	AT	3	6	607	612	50 %	50 %	0 %	0 %	384263632
5	NC_017061	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263632
6	NC_017061	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263632
7	NC_017061	A	6	6	697	702	100 %	0 %	0 %	0 %	384263632
8	NC_017061	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	384263632
9	NC_017061	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263632
10	NC_017061	TTTA	2	8	849	856	25 %	75 %	0 %	0 %	384263632
11	NC_017061	TA	3	6	855	860	50 %	50 %	0 %	0 %	384263632
12	NC_017061	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384263632
13	NC_017061	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263632
14	NC_017061	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384263632
15	NC_017061	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263632
16	NC_017061	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	384263632
17	NC_017061	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263632
18	NC_017061	CAAA	2	8	1131	1138	75 %	0 %	0 %	25 %	384263632
19	NC_017061	CCG	2	6	1159	1164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263632
20	NC_017061	GATT	2	8	1214	1221	25 %	50 %	25 %	0 %	384263632
21	NC_017061	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263632
22	NC_017061	GAAA	2	8	1268	1275	75 %	0 %	25 %	0 %	384263632
23	NC_017061	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384263632
24	NC_017061	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263632
25	NC_017061	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263632
26	NC_017061	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263632
27	NC_017061	GGC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263632
28	NC_017061	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263632
29	NC_017061	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263632
30	NC_017061	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263632
31	NC_017061	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263632
32	NC_017061	GAAA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	384263632
33	NC_017061	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384263632
34	NC_017061	TCG	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263633
35	NC_017061	TCAT	2	8	2099	2106	25 %	50 %	0 %	25 %	384263633
36	NC_017061	AGA	3	9	2113	2121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263633
37	NC_017061	CGAT	2	8	2139	2146	25 %	25 %	25 %	25 %	384263633
38	NC_017061	TGC	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263633
39	NC_017061	TTC	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263633
40	NC_017061	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	384263633
41	NC_017061	AATTT	2	10	2271	2280	40 %	60 %	0 %	0 %	384263633
42	NC_017061	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384263633
43	NC_017061	TTC	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263633
44	NC_017061	GCT	2	6	2665	2670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263633
45	NC_017061	TCG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263633
46	NC_017061	CTT	2	6	2769	2774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263633
47	NC_017061	AAC	2	6	2795	2800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263633
48	NC_017061	CGG	2	6	2823	2828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263633
49	NC_017061	TCA	2	6	2843	2848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384263633
50	NC_017061	GCTG	2	8	2884	2891	0 %	25 %	50 %	25 %	384263633
51	NC_017061	TTCA	2	8	2920	2927	25 %	50 %	0 %	25 %	384263633
52	NC_017061	AT	3	6	2935	2940	50 %	50 %	0 %	0 %	384263633
53	NC_017061	ATG	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263633
54	NC_017061	ATA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384263634
55	NC_017061	CGG	2	6	3285	3290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263634
56	NC_017061	GAGC	2	8	3309	3316	25 %	0 %	50 %	25 %	384263634
57	NC_017061	CAA	2	6	3330	3335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263634
58	NC_017061	CGC	2	6	3349	3354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263634
59	NC_017061	GTC	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263634
60	NC_017061	GC	3	6	3483	3488	0 %	0 %	50 %	50 %	384263635
61	NC_017061	ATC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384263635
62	NC_017061	GAAG	2	8	3649	3656	50 %	0 %	50 %	0 %	384263635
63	NC_017061	TGA	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263635
64	NC_017061	A	6	6	3703	3708	100 %	0 %	0 %	0 %	384263635
65	NC_017061	AGC	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263635
66	NC_017061	TCAG	2	8	3749	3756	25 %	25 %	25 %	25 %	384263635
67	NC_017061	GAG	3	9	3828	3836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384263635
68	NC_017061	A	6	6	3899	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	384263635
69	NC_017061	AGC	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263635
70	NC_017061	GAA	2	6	4093	4098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263635
71	NC_017061	AAAAGA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384263635
72	NC_017061	ATT	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384263635
73	NC_017061	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263635
74	NC_017061	T	6	6	4250	4255	0 %	100 %	0 %	0 %	384263635
75	NC_017061	CAG	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263635
76	NC_017061	ACG	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263635
77	NC_017061	GAA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263635
78	NC_017061	GAT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263635
79	NC_017061	GAT	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263635
80	NC_017061	CAC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384263635
81	NC_017061	AGTGA	2	10	4542	4551	40 %	20 %	40 %	0 %	384263635
82	NC_017061	GAC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263636
83	NC_017061	TCG	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263636
84	NC_017061	GAA	2	6	4659	4664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263636
85	NC_017061	GACA	2	8	4671	4678	50 %	0 %	25 %	25 %	384263636
86	NC_017061	GAAA	2	8	4679	4686	75 %	0 %	25 %	0 %	384263636
87	NC_017061	AGT	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263636
88	NC_017061	CCGT	2	8	4695	4702	0 %	25 %	25 %	50 %	384263636
89	NC_017061	AT	4	8	4741	4748	50 %	50 %	0 %	0 %	384263636
90	NC_017061	GAA	2	6	4775	4780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263636
91	NC_017061	CAG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263637
92	NC_017061	ATG	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263637
93	NC_017061	CAC	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384263637
94	NC_017061	TCG	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263637
95	NC_017061	ACA	2	6	5010	5015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263637
96	NC_017061	CGGT	2	8	5112	5119	0 %	25 %	50 %	25 %	384263637
97	NC_017061	GCC	2	6	5136	5141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263637
98	NC_017061	TCA	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384263637
99	NC_017061	CGG	2	6	5176	5181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263637
100	NC_017061	CGG	2	6	5212	5217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263637
101	NC_017061	CGTC	2	8	5235	5242	0 %	25 %	25 %	50 %	384263637
102	NC_017061	TCCGGA	2	12	5386	5397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384263637
103	NC_017061	AAC	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263637
104	NC_017061	AAG	2	6	5580	5585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263637
105	NC_017061	TTGCA	2	10	5643	5652	20 %	40 %	20 %	20 %	384263637
106	NC_017061	ATA	2	6	5694	5699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384263637
107	NC_017061	AAG	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263637
108	NC_017061	GAT	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263637
109	NC_017061	GA	3	6	5827	5832	50 %	0 %	50 %	0 %	384263637
110	NC_017061	ATT	2	6	5846	5851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384263637
111	NC_017061	TCT	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263637
112	NC_017061	CTT	2	6	5963	5968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263637
113	NC_017061	A	6	6	6038	6043	100 %	0 %	0 %	0 %	384263637
114	NC_017061	TTC	2	6	6112	6117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263637
115	NC_017061	GCGG	2	8	6164	6171	0 %	0 %	75 %	25 %	384263637
116	NC_017061	GGGAC	2	10	6184	6193	20 %	0 %	60 %	20 %	384263637
117	NC_017061	TC	3	6	6265	6270	0 %	50 %	0 %	50 %	384263637
118	NC_017061	TCA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384263637
119	NC_017061	TTA	2	6	6407	6412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384263637
120	NC_017061	TTC	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263637
121	NC_017061	ATC	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384263637
122	NC_017061	GCC	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263637
123	NC_017061	GCA	2	6	6490	6495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263637
124	NC_017061	AGC	2	6	6528	6533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263637
125	NC_017061	TGA	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263637
126	NC_017061	AC	3	6	7016	7021	50 %	0 %	0 %	50 %	384263638
127	NC_017061	TCAG	2	8	7043	7050	25 %	25 %	25 %	25 %	384263638
128	NC_017061	AATG	2	8	7158	7165	50 %	25 %	25 %	0 %	384263638
129	NC_017061	A	6	6	7195	7200	100 %	0 %	0 %	0 %	384263638
130	NC_017061	TCG	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263638
131	NC_017061	ACC	2	6	7235	7240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384263638
132	NC_017061	TTG	2	6	7310	7315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384263638
133	NC_017061	TTCGG	2	10	7330	7339	0 %	40 %	40 %	20 %	384263638
134	NC_017061	AG	3	6	7465	7470	50 %	0 %	50 %	0 %	384263638
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241	NC_017061	GGC	2	6	19072	19077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263642
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253	NC_017061	CGG	2	6	19653	19658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263642
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258	NC_017061	CGGG	2	8	20057	20064	0 %	0 %	75 %	25 %	384263643
259	NC_017061	GCG	2	6	20079	20084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263643
260	NC_017061	GCC	2	6	20128	20133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263643
261	NC_017061	GTC	2	6	20230	20235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263643
262	NC_017061	TGA	2	6	20298	20303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263643
263	NC_017061	TATT	2	8	20318	20325	25 %	75 %	0 %	0 %	384263643
264	NC_017061	CG	3	6	20326	20331	0 %	0 %	50 %	50 %	384263643
265	NC_017061	GCT	2	6	20420	20425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263643
266	NC_017061	GAT	2	6	20446	20451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263643
267	NC_017061	TGAT	2	8	20835	20842	25 %	50 %	25 %	0 %	384263644
268	NC_017061	AGAGA	2	10	20943	20952	60 %	0 %	40 %	0 %	384263644
269	NC_017061	AGA	2	6	20968	20973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263644
270	NC_017061	CAG	2	6	21002	21007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263644
271	NC_017061	A	6	6	21029	21034	100 %	0 %	0 %	0 %	384263644
272	NC_017061	ATT	2	6	21047	21052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384263644
273	NC_017061	GAA	2	6	21074	21079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263644
274	NC_017061	AAG	2	6	21083	21088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263644
275	NC_017061	TGA	2	6	21091	21096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263644
276	NC_017061	ACG	2	6	21116	21121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263644
277	NC_017061	GAT	2	6	21188	21193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263644
278	NC_017061	CG	3	6	21356	21361	0 %	0 %	50 %	50 %	384263644
279	NC_017061	TGA	2	6	21391	21396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263644
280	NC_017061	TCC	2	6	21418	21423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384263644
281	NC_017061	AGA	2	6	21499	21504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263644
282	NC_017061	ATT	2	6	21507	21512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384263644
283	NC_017061	CGG	2	6	21525	21530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263644
284	NC_017061	GCTT	2	8	21608	21615	0 %	50 %	25 %	25 %	384263644
285	NC_017061	CAA	2	6	21676	21681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263644
286	NC_017061	GAG	2	6	21722	21727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384263644
287	NC_017061	GCT	2	6	21766	21771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263644
288	NC_017061	CCAAG	2	10	21857	21866	40 %	0 %	20 %	40 %	384263644
289	NC_017061	TCT	2	6	21884	21889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263644
290	NC_017061	CAG	2	6	22034	22039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263644
291	NC_017061	ATT	2	6	22055	22060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384263644
292	NC_017061	TCA	2	6	22098	22103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384263644
293	NC_017061	GC	3	6	22128	22133	0 %	0 %	50 %	50 %	384263645
294	NC_017061	T	6	6	22135	22140	0 %	100 %	0 %	0 %	384263645
295	NC_017061	GCG	2	6	22156	22161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263645
296	NC_017061	GCG	2	6	22339	22344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263645
297	NC_017061	CGG	2	6	22349	22354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263645
298	NC_017061	ATCTG	2	10	22423	22432	20 %	40 %	20 %	20 %	384263645
299	NC_017061	ACA	2	6	22453	22458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263645
300	NC_017061	TCT	2	6	22616	22621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263645
301	NC_017061	GCG	2	6	22696	22701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263645
302	NC_017061	GA	4	8	22727	22734	50 %	0 %	50 %	0 %	384263645
303	NC_017061	GC	3	6	22823	22828	0 %	0 %	50 %	50 %	384263645
304	NC_017061	CCG	2	6	22843	22848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263645
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321	NC_017061	CCG	2	6	24114	24119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263646
322	NC_017061	AAAT	2	8	24165	24172	75 %	25 %	0 %	0 %	384263646
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325	NC_017061	GTCT	2	8	24400	24407	0 %	50 %	25 %	25 %	384263647
326	NC_017061	AT	3	6	24453	24458	50 %	50 %	0 %	0 %	384263647
327	NC_017061	TCT	2	6	24464	24469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263647
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332	NC_017061	ACTCC	2	10	24820	24829	20 %	20 %	0 %	60 %	384263647
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340	NC_017061	GTTTT	2	10	25784	25793	0 %	80 %	20 %	0 %	384263648
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344	NC_017061	GCC	2	6	25999	26004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263648
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356	NC_017061	CA	3	6	26597	26602	50 %	0 %	0 %	50 %	384263649
357	NC_017061	TAAT	2	8	26626	26633	50 %	50 %	0 %	0 %	384263649
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375	NC_017061	GCG	2	6	27451	27456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263650
376	NC_017061	T	6	6	27491	27496	0 %	100 %	0 %	0 %	384263650
377	NC_017061	AAAG	2	8	27515	27522	75 %	0 %	25 %	0 %	384263650
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381	NC_017061	AATG	2	8	28250	28257	50 %	25 %	25 %	0 %	384263651
382	NC_017061	GCG	2	6	28259	28264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263651
383	NC_017061	GCG	2	6	28313	28318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263651
384	NC_017061	TA	3	6	28395	28400	50 %	50 %	0 %	0 %	384263651
385	NC_017061	CT	3	6	28421	28426	0 %	50 %	0 %	50 %	384263651
386	NC_017061	GAA	2	6	28460	28465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263651
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389	NC_017061	AGC	2	6	28611	28616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263651
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